В расширениях гнома обнаружил годную проверку обновлений для гнома. Висит себе среди индикаторов да по заданному времени проверяет апдейты. При появлении обновлений может вывести уведомление, циферку апдейтов поставить на своем индикаторе, а может и вообще индикатор не показывать пока апдейтов нет. Так же в выпадающем меню отображается список пакетов имеющих апдейты. Всё как у взрослых ☺

Ну а при желании запусткаете сам апдейт, хоть через yaourt хоть через 'echo "я обновился"', т.е. в настройках прописывается команды для обновления.
У меня прописано (y это алиан на yaourt)

gnome-terminal -e 'zsh -c "y -Syu ; echo Done - Press enter to exit; read"'

Расширение живет тут, оттуда же и устанавливается в гном.