
Т.е. repo-clean удаляет все файлы пакетов акромя последней версии, а cacheclean позволяет указать сколько последних версий сохранять…
pkgcacheclean — аналог cacheclean, но уже написан на сях и удаляет все неиспользуемые пакеты, грубо говоря это pacman -Sc && cacheclean 2 (2, ибо pkgcacheclean по умолчанию оставляет две последнии версии пакета, хотя количество оставляемых версий можно изменить).
Обе утилитки имеются в AUR
Ну и не забываем о опции CleanMethod = KeepCurrent в pacman.conf позволяющей
оставлять не установленные пакеты с помощью pacman -Sc